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DFG Sonderforschungsbereich 1444

Der Sonderforschungsbereich zielt darauf ab, am Beispiel der Knochenheilung die grundlegenden Mechanismen zu entschlüsseln, die zwischen Erfolg und Misserfolg bei der Regeneration von muskuloskelettalem Gewebe ausschlaggebend sind.

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Teilprojekt 2 - Projektleitung

Prof. Dr. Hans-Dieter Volk

SFB 1444 Stellvertretender Sprecher & Ombudsperson, Teilprojekte 1 & 2 | FOR 2165 Teilprojekt 5

Einfluss der epigenetischen Regulation auf die an der Knochenbruchheilung beteiligten T-Subsets

Polansky-Biskup und Volk untersuchen, welchen Einfluss die epigenetische Regulierung auf T-Zelluntergruppen hat, die an der Heilung von Knochenbrüchen beteiligt sind. Ziel ist es, die entscheidenden epigenetischen Akteure ("epigenetische Schalterregionen") zu identifizieren, die die Differenzierung, Migration und Funktion der schädlichen pro-inflammatorischen Effektor-T-Zellen (Teff) und der nützlichen regulatorischen T-Zellen (Treg) während der erfolgreichen oder gestörten Knochenregeneration steuern. Zu diesem Zweck erstellen Polansky-Biskup und Volk detaillierte molekulare Signaturen (Epigenom, Transkriptom, Oberflächenproteom, T-Zell-Rezeptor-Profil) von primären menschlichen Teff- und Treg-Zellen aus Ex-vivo-Material von Patienten mit Knochenbrüchen. Darüber hinaus werden die Auswirkungen von proliferationsinduzierten Seneszenzmechanismen, die im Epigenom eingeprägt sind, in den relevanten T-Zell-Untergruppen analysiert.

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Wichtigste Ergebnisse

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Einzelzell-Multiomics-Profilen

Entzündungsreaktion | Kraftübertragung & Sensorik

Erstellung von Einzelzell-Multiomics-Profilen von T-Zell-Untergruppen, die die Knochenregeneration negativ beeinflussen.

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DNA-Methylom

Entzündungsreaktion | Kraftübertragung & Sensorik

Proliferationsinduzierte zelluläre Seneszenz in T-Zellen ist im DNA-Methylom verankert.

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Enhancer-Landschaft

Entzündungsreaktion | Kraftübertragung & Sensorik

Die Enhancer-Landschaft bestimmt die Fähigkeit der Stromazellen zur Regeneration des Skeletts.

Hochmann et al. Sci Transl Med. 2023 | In Zusammenarbeit mit Teilprojekt P05 und P16

Team

Anamika Giri (Postdoc)

Computational analysis of single cell TEA (Transcriptome, Epitopes, Accessibility) sequencing data of T lymphocyte subsets

Frederik Hamm (Doktorand)

Epigenetically imprinted senescence in T lymphocytes

Iuliia Kotko (Medizin Doktorandin)

Deep cellular and molecular phenotyping of T lymphocytes

Stephan Schlickeiser (leitender Wissenschaftler)

Single-cell multiomics analysis of T lymphocyte subsets

Désirée Jacqueline Wendering (Postdoc)

Profiling of T lymphocyte subsets using various single-cell multiomics techniques

Publikationen

  • Hochmann, S.; Ou, K.; Poupardin, R.; Mittermeir, M.; Textor, M.; Ali, S.; Wolf, M.; Ellinghaus, A.; Jacobi, D.; Elmiger, J. A. J.; Donsante, S.; Riminucci, M.; Schafer, R.; Kornak, U.; Klein, O.; Schallmoser, K.; Schmidt-Bleek, K.; Duda, G. N.; Polansky, J. K.; Geissler, S.; Strunk, D.


    The enhancer landscape predetermines the skeletal regeneration capacity of stromal cells

    Sci Transl Med 2023; 15(688):eabm7477.

 

 

 

 

Gegründet durch die DFG (Projektnummer: 427826188)
Förderzeitraum 2021-2024