DFG Sonderforschungsbereich 1444
Der Sonderforschungsbereich zielt darauf ab, am Beispiel der Knochenheilung die grundlegenden Mechanismen zu entschlüsseln, die zwischen Erfolg und Misserfolg bei der Regeneration von muskuloskelettalem Gewebe ausschlaggebend sind.
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Teilprojekt 2 - Projektleitung
SFB 1444 Stellvertretender Sprecher & Ombudsperson, Teilprojekte 1 & 2 | FOR 2165 Teilprojekt 5
Einfluss der epigenetischen Regulation auf die an der Knochenbruchheilung beteiligten T-Subsets
Polansky-Biskup und Volk untersuchen, welchen Einfluss die epigenetische Regulierung auf T-Zelluntergruppen hat, die an der Heilung von Knochenbrüchen beteiligt sind. Ziel ist es, die entscheidenden epigenetischen Akteure ("epigenetische Schalterregionen") zu identifizieren, die die Differenzierung, Migration und Funktion der schädlichen pro-inflammatorischen Effektor-T-Zellen (Teff) und der nützlichen regulatorischen T-Zellen (Treg) während der erfolgreichen oder gestörten Knochenregeneration steuern. Zu diesem Zweck erstellen Polansky-Biskup und Volk detaillierte molekulare Signaturen (Epigenom, Transkriptom, Oberflächenproteom, T-Zell-Rezeptor-Profil) von primären menschlichen Teff- und Treg-Zellen aus Ex-vivo-Material von Patienten mit Knochenbrüchen. Darüber hinaus werden die Auswirkungen von proliferationsinduzierten Seneszenzmechanismen, die im Epigenom eingeprägt sind, in den relevanten T-Zell-Untergruppen analysiert.
Wichtigste Ergebnisse
Einzelzell-Multiomics-Profilen
Entzündungsreaktion | Kraftübertragung & Sensorik
Erstellung von Einzelzell-Multiomics-Profilen von T-Zell-Untergruppen, die die Knochenregeneration negativ beeinflussen.
DNA-Methylom
Entzündungsreaktion | Kraftübertragung & Sensorik
Proliferationsinduzierte zelluläre Seneszenz in T-Zellen ist im DNA-Methylom verankert.
Enhancer-Landschaft
Entzündungsreaktion | Kraftübertragung & Sensorik
Die Enhancer-Landschaft bestimmt die Fähigkeit der Stromazellen zur Regeneration des Skeletts.
Hochmann et al. Sci Transl Med. 2023 | In Zusammenarbeit mit Teilprojekt P05 und P16
Team
Computational analysis of single cell TEA (Transcriptome, Epitopes, Accessibility) sequencing data of T lymphocyte subsets
Epigenetically imprinted senescence in T lymphocytes
Deep cellular and molecular phenotyping of T lymphocytes
Single-cell multiomics analysis of T lymphocyte subsets
Profiling of T lymphocyte subsets using various single-cell multiomics techniques
Publikationen
- Autoren:Hochmann, S.; Ou, K.; Poupardin, R.; Mittermeir, M.; Textor, M.; Ali, S.; Wolf, M.; Ellinghaus, A.; Jacobi, D.; Elmiger, J. A. J.; Donsante, S.; Riminucci, M.; Schafer, R.; Kornak, U.; Klein, O.; Schallmoser, K.; Schmidt-Bleek, K.; Duda, G. N.; Polansky, J. K.; Geissler, S.; Strunk, D.
Zeitschrift (Journal):Sci Transl Med Jahr:2023; Jahrgang (Volume):15Ausgabe (Issue):(688):Seiten (Pages):eabm7477.
Titel:The enhancer landscape predetermines the skeletal regeneration capacity of stromal cells
Gegründet durch die DFG (Projektnummer: 427826188)
Förderzeitraum 2021-2024